天正13年（1585）豊臣秀次は、秀吉から近江20万石をもって、当地に封ぜられた。秀次による町づくりは、八幡山の一画を切り崩して沼地の水を抜き、町の西半分を占める沼地を埋め立て、埋め立て地の町並みには上下水道を造るなど、広範な土木工事を伴うものであった。

　天正18年（1590）小田原落城後秀次は岐阜竹ヶ鼻へ転封となり、そのあと京極高次が2万8000石でこの地に封ぜられている。 

　江戸期に入ると幕府領となり、元禄11年（1698）には新町以西が朽木領に、宝永5年（1708）全町朽木領に、文政9年（1826）再び全町幕府領に、天保13年（1842）尾張徳川領となった。